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抗日灼雜種金葉榆轉錄組初步分析

宋文龍  葛卉  劉興菊  梁海永  
【摘要】:比較分析兩種雜種金葉榆的轉錄組數據,研究金葉榆葉片受到日灼后的基因表達調控機制。本研究對黑榆和金葉榆雜交后代以及雄性不育白榆和金葉榆的雜交后代進行無參轉錄組測序分析。經過篩選得到1453個差異表達基因,其中735個基因表達上調,718個基因表達下調。GO富集功能注釋到699個差異表達基因,主要涉及到生物合成過程、細胞過程、催化活性等生理生化過程;通過COG注釋分析,發現差異表達基因主要注釋在碳水化合物運輸和代謝、次生代謝產物的生物合成運輸和代謝、脂質運輸和代謝、只有一般功能預測和信號傳導機制;499條差異基因被注釋到KEGG數據庫中的49條通路中,通路顯著富集在類黃酮合成、二苯乙烯類,二芳基庚烷類和銀杏醇生物合成、氧化磷酸化、苯丙烷類生物合成等;通過對類黃酮合成通路富集分析,發現抗日灼能力高的葉片中兒茶素、半食子酸、兒茶酚、柚皮素、3,5,7,4‘-四羥黃酮和二氫槲皮素等含量明顯升高,表明黃酮類化合物對葉片抗日灼能力有重要影響。氧化磷酸化通路中差異表達基因上調直接影響酶活,使葉片代謝速率和抗氧化能力提高,對葉片抗日灼能力產生很大影響。本研究為進一步挖掘抗日灼基因提供參考。

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