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山東地區犬冠狀病毒的分子流行病學調查及其基因型多樣性分析

張傳美  李文鳳  張路賓  劉佳卉  單虎  楊海燕  
【摘要】:【目的】為了解分析山東地區健康犬及腹瀉犬中犬冠狀病毒(CCoV)的分子流行病學及其基因型,【方法】采集2017年以來山東省寵物市場、流浪犬中心、犬舍、各地寵物醫院等的健康和腹瀉犬只的肛拭子樣品,PCR方法檢測CCoV及其CCoV-Ⅰ和CCoV-Ⅱ(CCoV-Ⅱa和CCoV-Ⅱb)基因分型情況,并對擴增出的M、S全基因進行測序分析。【結果】結果表明,199份樣品中,共檢出CCoV陽性樣品79份,健康犬中的檢出率為40.2%(33/82),腹瀉犬中的檢出率為39.3%(46/117)。健康犬中CCoV-Ⅰ型與CCoV-Ⅱ型陽性檢出率分別為78.8%(26/33)和51.5%(17/33);腹瀉犬中CCoV-Ⅰ型與CCoV-Ⅱ型陽性檢出率分別為39.13%(18/46)和80.4%(37/46)。基因型陽性比率分析表明,健康犬中單獨感染CCoV-I型的比率最高,為48.5%(16/33);腹瀉犬中單獨感染CCoV-Ⅱa比率最高,為47.8%(22/46)。測序分析獲得48株M基因序列,遺傳進化分析表明,12株CCoV-Ⅰ型毒株中除1株外,其余均從健康犬中分離。36株CCoV-Ⅱ型毒株中除7株來自健康犬外,其余均為腹瀉犬中獲得。獲得的3株S全基因均來自腹瀉犬且均屬于CCoV-Ⅱa亞型。【結論】山東地區犬群中CCoV檢出率較高,說明CCoV廣泛流行,健康犬和腹瀉犬中均存在多重感染情況,健康犬中主要流行CCoV毒株為CCoV-Ⅰ型,腹瀉犬中主要流行CCoV-Ⅱa型。

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